Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc13P50207 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms