Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmod1P49813 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms