Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms