Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl3P27659 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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