Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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