Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms