Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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