Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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