Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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