Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AI481877A2ALV5 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AI481877A2ALV5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AI481877A2ALV5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AI481877A2ALV5 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms