Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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