Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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