Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Med29Q9DB91 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Med29Q9DB91 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms