Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms