Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp40Q8BWR4 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp40Q8BWR4 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp40Q8BWR4 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp40Q8BWR4 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp40Q8BWR4 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp40Q8BWR4 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp40Q8BWR4 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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