Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms