Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms