Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atg9aQ68FE2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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