Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BcanQ61361 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms