Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5460Q3UQ97 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms