Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Acox2-201ENSMUST00000022271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Osbpl3-203ENSMUST00000114466 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Etos1-201ENSMUST00000057134 2015 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Il17rd-205ENSMUST00000226105 2923 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Sox2ot-210ENSMUST00000197697 2533 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccbe1Q3MI99 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms