Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms