Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms