Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms