Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms