Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pitx2P97474 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms