Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rhbdd1-201ENSMUST00000027322 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm31135-201ENSMUST00000208460 1782 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gramd1b-203ENSMUST00000119373 3857 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mfsd8-201ENSMUST00000026859 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms