Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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