Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5bP56480 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms