Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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