Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd8P23463 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd8P23463 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd8P23463 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd8P23463 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd8P23463 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd8P23463 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd8P23463 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd8P23463 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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