Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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