Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ScaperF8VQ70 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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