Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cfap46E9Q2C0 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms