Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm2A2A7B5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms