Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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