Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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