Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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