Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms