Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms