Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifi35Q9D8C4 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms