Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RtcAQ9D7H3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RtcAQ9D7H3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms