Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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