Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms