Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ercc8Q8CFD5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ercc8Q8CFD5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ercc8Q8CFD5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ercc8Q8CFD5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ercc8Q8CFD5 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ercc8Q8CFD5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ercc8Q8CFD5 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ercc8Q8CFD5 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ercc8Q8CFD5 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ercc8Q8CFD5 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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Ercc8Q8CFD5 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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Ercc8Q8CFD5 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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Ercc8Q8CFD5 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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Ercc8Q8CFD5 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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Ercc8Q8CFD5 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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