Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rdh13Q8CEE7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rdh13Q8CEE7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rdh13Q8CEE7 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rdh13Q8CEE7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rdh13Q8CEE7 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rdh13Q8CEE7 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rdh13Q8CEE7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh13Q8CEE7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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