Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hdac7Q8C2B3 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms