Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp40Q8BWR4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp40Q8BWR4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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