Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms