Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms